هدف از مطالعه و تبیین کتاب طرح کلی اندیشه اسلامی در قرآن، تبیین مباحث اسلام بر مبنای قرآن می‌باشد. این کتاب با مبنا قرار دادن آیات قرآن برای تبیین اصول اعتقادی اسلامی، موجب وحدت آفرینی برای امت اسلامی شده است. در واقع مطالعه این کتاب عاملی در راستای مطالعه هماهنگ و پیوسته مسائل فکری اسلام به عنوان اجزای یک مجموعه واحد، استنباط اصول اساسی اسلام از قرآن، دوری از سلیقه‌ها و نظرت شخصی و در نهایت ارائه نگاهی نو به مفاهیم دینی همچون ولایت است.